Ekdal skadades otäckt i Burnleys ligacupmatch i veckan och har tvingats lämna återbud.
"Det är tråkigt för Hjalmar och för oss", säger förbundskapten Janne Andersson till svenska fotbollförbundets webbplats.
Lagerbielke kom till skotska Celtic från Elfsborg tidigare i somras. Han har gjort en landskamp för Sverige.
Under samlingen ställs Sverige mot Estland och Österrike i kvalspelet till EM 2024.